Les initiatives visant à développer l'agriculture biologique (AB) pour répondre à un problème de qualité de l'eau se multiplient. Cet article propose une étude comparée de 4 projets s'appuyant sur 42 entretiens semi directifs auprès d'acteurs institutionnels (agents des services de l'Etat, des collectivités locales, des agences de l'eau), d'élus locaux, d'animateurs agricoles, d'acteurs des filières et d'agriculteurs. Nous avons identifié deux logiques d'action publique. La première vise à concentrer les actions sur les zones à enjeu eau et s'appuie principalement sur les mesures agri-environnementales territorialisées « conversion à l'agriculture biologique ». La seconde logique est davantage pensée dans une perspective de développement de l'AB ; elle est mise en oeuvre dans des territoires considérés comme pertinents pour cet objectif. Les principales actions concernent ici l'animation, la sensibilisation des acteurs agricoles à l'AB et l'appui à la structuration de filières pour la mise en marché de produits biologiques. Nos résultats montrent aussi que les réseaux d'acteurs diffèrent selon les contextes locaux, les porteurs de projets et leurs objectifs et tendent à se complexifier au cours du temps. Ceci explique que de tels projets soient complexes et longs à mettre en place. Pour autant la préservation de l'eau est devenue un enjeu pour le développement de l'AB. Ceci nous amène à revisiter les modèles théoriques de développement de l'AB pour les enrichir d'une dimension territoriale.